重庆的教育部直属大学有以下两所：

重庆大学

成立于1929年，是国家“211工程”和“985工程”重点建设的高水平研究型综合性大学，也是“世界一流大学建设高校（A类）”。

西南大学

起源于1906年建立的川东师范学堂，是教育部直属的211工程大学，由原西南师范大学和西南农业大学合并组建而来。

这两所大学在各自的领域有着卓越的成就和特色，为重庆乃至全国的高等教育事业做出了显著贡献。