南京水利专业中， 河海大学是最好的选择。河海大学在水利专业方面具有显著的优势和特色，是教育部直属的全国重点大学，也是国家“211工程”和“985工程”重点建设高校。河海大学的水利工程专业是国家一流的学科建设专业，也是我国第一所有着水利专业的高校，被誉为我国水利工程第一高校。

河海大学依靠本身的不断努力，逐渐发展成了一所工科为主的高校，水利专业为特色的高校，多样化学科的结合，共同发展的重点高校，高校的建设规模宏大，环境优美，是一个非常优美的高校。学校的教学特色突出，主要是以水利专业为发展特色，是我国第一所有着水利专业的高校，是我国水利工程第一高校，给我国的水利工程领域培养了大批人才。

在各类大学排名中，河海大学通常位于前列，例如在软科国内大学排行榜中位于第79名，在QS以及USnews国内大学排行榜中分别位于第93名和68名。此外，河海大学在水利工程学科方面获得A+，与清华大学并列，处于全国顶尖位置。

综上所述，河海大学在水利工程领域的排名最高，是南京地区水利专业排名最为靠前的高校。