常熟理工学院拥有多个专业，其中一些专业被认为是王牌专业，具体如下：

自动化：

自动化专业是常熟理工学院的王牌专业，主要学习机械、自动化等相关的知识和软硬件操作，动手能力要求高，毕业后的就业率较高。

数学与应用数学：

数学与应用数学也是学校的王牌专业，有两个主要方向：师范方向和软件方向。师范方向主要是学习数学知识及教学技能，软件方向则从事软件设计、研发和管理工作。

机械工程：

机械制造及其自动化、车辆工程等方向，专注于服务地方制造业，培养高素质应用型工程技术人才，与地方企业合作紧密，学生就业率和专业对口率高。

材料科学与工程：

重点研究新型材料及其加工工艺，服务于长三角地区的先进制造业和新材料产业。

电气工程及其自动化：

学科注重电气控制系统、智能电网和新能源方向，实验室设备完善，拥有产学研一体化的实践平台。

信息与通信工程：

包括计算机科学与技术、电子信息工程等专业，与地方信息技术企业合作，培养软件开发、智能控制等方向的人才。

化学与环境工程：

环境科学与工程和化学工程与工艺是特色专业，研究方向包括环境治理技术、新型催化剂开发和化工过程优化。

经济与管理学科：

财务管理、国际经济与贸易、市场营销等专业为特色，聚焦服务地方中小企业经济发展，培养既懂理论又具实践能力的复合型人才。

新能源科学与工程：

该专业入选了国家级特色专业建设点，是教育部卓越工程师教育培养计划专业。

生物工程：

该专业也是常熟理工学院的王牌专业之一。

电子信息工程：

该专业入选了国家级特色专业建设点，是教育部卓越工程师教育培养计划专业。

食品质量与安全：

该专业也是常熟理工学院的重点专业之一。

计算机科学与技术：

该专业入选了国家级特色专业建设点，是教育部卓越工程师教育培养计划专业。

市场营销：

该专业也是常熟理工学院的重点专业之一。

这些专业在教学质量和研究实力方面都有较高水平，并且得到了国家级和省级的认可。建议根据个人兴趣和职业规划选择合适的专业。