济宁拥有以下荣誉大学：

曲阜师范大学

全国首批招收研究生高校

山东省重点大学

山东省一流学科建设高校

获得“中国海洋大学2024年卓越生源高中”荣誉称号

济宁医学院

国家首批卓越医生教育培养计划

山东省卓越工程师教育培养计划的一部分

具有学士、硕士学位授予权

济宁学院

教育部批准设立的全日制普通本科高等院校

省级硕士培育建设单位

山东理工职业学院

济宁地区另一所重要的高职院校

这些荣誉反映了济宁高等教育机构在教学质量和学生培养方面的优秀表现。