以下是一些设有指挥系的大学：

国防科技大学：

被誉为军中清华，是军校的最高学府。

中央音乐学院指挥系：

中国指挥教学历史最悠久的系，培养了许多著名指挥家。

陆军指挥学院：

位于江苏省南京市，是培养陆军中高级指挥人才的院校。

海军指挥学院：

位于南京市，是海军最高学府，培养海军中高级指挥人才。

空军指挥学院：

位于北京西郊，是培养空军师团职指挥军官的中级指挥院校。

武警指挥学院：

为武警部队培养中高级指挥人才、高级理论人才、高级参谋人才和优秀师资人才。

火箭军指挥学院：

负责培养火箭军指挥人才。

中国人民解放军空军航空大学。

解放军理工大学。

中国人民武装警察部队指挥学院。

建议根据个人兴趣和职业规划，选择合适的学院进行报考。