截至2024年，图木舒克市有两所大学，分别是新疆政法学院和图木舒克职业技术学院。根据提供的信息，这两所大学的排名如下：

新疆政法学院：

位于新疆五家渠市和图木舒克市，是图木舒克市唯一的一所本科院校，因此在图木舒克市排名第一。

图木舒克职业技术学院：

也位于图木舒克市，是一所专科学校，因此在图木舒克市排名第二。

综上所述，2025年图木舒克市的大学排名中，新疆政法学院排名第一，图木舒克职业技术学院排名第二。