玉山镇至少有一所大学，即昆山杜克大学。

昆山杜克大学是一所世界顶级名校在中国开办的分校，由中国教育部批准，2014年正式招生。这所大学的发展定位是世界一流综合性研究型大学。

此外，武夷学院玉山健康管理学院也是位于玉山镇的一所大学，但该校是与台湾玉山大学联盟合作创办的新型二级学院，负责闽台合作培养应用型人才试点工作，于2015年开始招生。

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