以下是一些拥有院士的日本大学：

东京大学：

东京大学是日本顶尖的大学，培养了多位诺贝尔奖得主，包括物理学奖得主朝永振一郎、江崎玲于奈、小柴昌俊、南部阳一郎，以及化学奖得主梶田隆章和大隅良典等。

京都大学：

京都大学同样是日本顶尖的大学，培养了多位诺贝尔奖得主，如物理学奖得主汤川秀树、福井谦一、利根川进和赤崎勇等。

名古屋大学：

名古屋大学是日本著名的综合性大学，在多个学科领域实力强劲，包括物理学奖得主小林诚和益川敏英等。

早稻田大学：

早稻田大学是日本极负盛名的世界顶尖学府，部分教师还担任早大不同学院的室长或副室长、院士、实验室主任。

东京理科大学：

东京理科大学管理学院商业经济系教授施建明当选为日本工程院外籍院士。

北海道大学：

日本北海道大学工学院教授上田多门当选为日本工程院院士。

这些大学在日本及全球学术界都有很高的声誉，并且有多位院士和诺贝尔奖得主，显示出其在科研和学术方面的卓越成就。