生物质科学与工程专业的课程设置涵盖了生物质能源、生物质工程、环境保护、化学分析、微生物学等多个领域。具体课程包括：

生物质能源课程：

涉及生物质能源的种类、转化技术、生产工艺等方面。

生物质工程课程：

包括生物质的分离、提纯、转化等工艺过程，以及生物质产品的制备和加工等方面的知识。

环境保护课程：

涉及环境污染控制、生态修复等方面的课程。

化学分析课程：

包括化学分析方法、实验技术等方面的知识。

微生物学课程：

涵盖微生物的分类、生理生化、遗传等方面的知识。

生物质工程概论、新能源概论、生物质催化转化、生物质热化学转化、生物质能学、物理化学、材料化学、生物代谢工程、发酵工程、生物质化学品与功能材料制备原理、新能源工程项目规划与设计、能源作物概论、新能源与环境系统工程等。

无机化学与化学分析、植物组织培养技术、有机化学、生物化学、化工原理、生化工程、细胞生物学、遗传学、分子生物学、基因工程、细胞工程、蛋白质工程、微生物工程、生物工程下游技术、发酵工程设备、概率论与数理统计、动物生理学、生态学等。

电工电子技术、流体力学基础、热工基础、能源化学、电机技术、工程制图与CAD、热力设备传热分析与应用、电力系统基础、生物质特性及加工技术、生物质液体燃料生产制备技术、生物质固化塑形技术、生物质气化技术、生物质发电技术、生物质锅炉原理及运行、生物质电厂运行维护及环境保护、安全生产技术等。

生物质锅炉技术、工程热力学、流体力学、传热学、控制理论、测试技术、固态废物利用等。

这些课程旨在培养学生掌握生物质资源、生物质能源、生物质材料、生物基化学品等领域的基础知识和基本技能，具备利用现代工具对相关复杂工程问题进行分析、研究、解决和管理的能力，能在国家生物质能源及材料领域开展教学、科研、技术开发、工程应用、经营管理等方面工作的行业领军型人才。