大学档案的缺点主要包括以下几个方面：

资源限制：

档案寄回生源地可能导致失去学校提供的优质教育资源。

手续繁琐：

离开生源地就业可能需要重新办理改派手续，档案留校超过两年未就业，学校可能将其迁回生源地。

信息不畅：

档案转至就业代理或人才交流中心可能导致与学校交流减少，信息传递不畅。

影响个人发展：

档案在外地可能影响工作、评职称和调职，个人调档案和户籍可能受到限制。

诚信档案细节不足：

诚信档案可能忽略了学生日常生活行为，未能全面关注诚信细节。

档案管理不被重视：

档案管理工作不被重视，缺乏保密措施，档案存放地点可能没有足够的安全保障。

档案管理工具落后或保密性不足：

纸质档案可能因年份久远而遗失或错漏，电子版档案可能因管理不当而泄露。

档案管理人员专业不足：

档案管理人员可能因领导重视不足而被随意招收，工作可能疏忽大意，增加信息泄露风险。

档案整理不规范：

档案整理可能不规范，导致信息填写不完整或存在虚假信息。

档案收集不齐全：

信息收集可能不全面，多为虚假信息，缺乏系统的收集程序和完整的执行标准。

档案转递程序问题：

档案转递可能通过非安全的方式，如邮寄或本人自带，档案接收单位可能未能及时反馈接收信息。

档案存放和转递规定：

档案存放地点可能不符合规定，档案转出应通过机要通信或邮政特快专递，严禁个人自带。

档案与户籍问题：

毕业生离校后，档案和户口的转移可能出现问题，对于出国留学的毕业生，档案的保管可能有特殊规定。

档案意识淡薄：

档案具有原始性和法律凭证性，但可能因意识淡薄而被忽视。

管理理念陈旧：

高校领导对档案管理工作重视不足，相关经费投入力度与实际需求存在差距，档案网络化建设设备不能及时更新换代。

档案管理方法繁琐：

传统档案管理方法工作量巨大，简单手工操作难以满足需求，电脑管理仅局限于简单搜寻与查询。

档案管理相应制度缺失：

高校档案管理部门未能履行好职务，缺乏工作准则和制度的制定与完善。

档案管理流程不规范：

档案收集、整理、存储等环节缺乏统一标准和规定，导致效率低下，容易出现丢失或遗漏。

档案信息化水平不高：

档案管理系统建设和使用存在问题，系统功能不够完善，用户操作不便。

档案安全风险：

档案信息量大、种类繁多，存在被盗、被篡改、遗失等安全风险。

这些缺点反映了大学档案管理在多个方面存在的问题，需要从制度、技术、人员等多个层面进行改进和优化。