南通的公办本科大学主要有以下几所：

南通大学

简介：南通大学是南通市唯一的公办本科院校，也是江苏省重点支持的高水平大学。学校有16个学院，涵盖了理、工、文、法、经、管、教育、艺术、医学等多个领域。南通大学的教学质量和科研水平一直处于江苏省高水平大学的行列。

历史：学校始建于1912年，源自近代著名实业家、教育家张謇先生创办的私立南通医学专门学校和南通纺织专门学校。2004年5月，南通医学院、南通工学院、南通师范学院三所公办本科院校合并组建新的南通大学。

南通理工学院

简介：南通理工学院是经国家教育部批准建立的一所全日制普通本科高校，创始于2000年。虽然它是一所民办高校，但在南通地区也有一定的影响力。

历史：学校前身为紫琅职业技术学院，2014年升格为本科院校。

南通大学杏林学院

简介：南通大学杏林学院是南通大学举办的民办本科独立学院，设有多个本科专业。

综上所述，南通的公办本科大学主要是南通大学，此外还有南通理工学院和南通大学杏林学院，但南通理工学院是民办高校。