截至2025年，南疆大学排名如下：

新疆大学：

全国排名第175位，省内排名第1。

新疆医科大学：

全国排名第225位，省内排名第2。

石河子大学：

全国排名第231位，省内排名第3。

新疆农业大学：

全国排名第235位，省内排名第4。

新疆师范大学：

全国排名第245位，省内排名第5。

建议：

新疆大学作为南疆唯一一所进入全国前200强的高校，具有明显的优势，建议优先考虑。

新疆医科大学和 石河子大学在全国排名中紧随新疆大学之后，也是较为理想的选择，尤其是对于医学和农业科学相关专业的学生。

新疆师范大学虽然全国排名相对较低，但在教师教育和人文社科领域有较强实力，适合希望从事教育工作的学生。

新疆农业大学在农业科学领域有显著优势，适合对农业科学感兴趣的学生。