南京在篮球方面表现突出的大学有以下几所：

南京大学：

南京大学在南京市大学生篮球联赛中表现出色，曾多次夺得冠军。

南京农业大学：

南京农业大学也是南京市大学生篮球联赛的强队之一，曾多次进入决赛。

南京理工大学：

南京理工大学在篮球赛事中同样表现强劲，是南京市大学生篮球联赛的有力竞争者。

东南大学：

东南大学在篮球方面也有很好的表现，多次在联赛中取得好成绩。

南京航空航天大学：

南京航空航天大学在篮球赛事中也有一定的竞争力。

南京工程学院：

本科男子组中，南京工程学院排名第二。

南京工业大学：

本科男子组和本科女子组中，南京工业大学均有所表现。

南京林业大学：

本科男子组和本科女子组中，南京林业大学均有所表现。

河海大学：

本科男子组和本科女子组中，河海大学均有所表现。

南京医科大学：

本科女子组中，南京医科大学排名靠前。

南京森林警察学院：

本科男子组中，南京森林警察学院排名靠前。

南京体育学院：

虽然在全国排名第328位，但专注于体育教育，是南京地区最好的体育类学校。

建议：

如果综合考虑学术水平和篮球实力，南京大学、南京农业大学和南京理工大学可能是最强的篮球大学。

如果关注专业体育教育，南京体育学院也是一个很好的选择。