赣县区目前拥有的大学包括：

本科学校

赣南医学院

赣南师范大学

江西理工大学

江西理工大学应用科学学院（独立学院，三本）

赣南师范大学科技学院（独立学院，三本）

专科学校

江西环境工程职业学院

江西应用技术职业学院

赣州师范高等专科学校

赣州职业技术学院

赣南卫生健康职业学院

其他教育机构

赣州医学高等专科学校（在建）

赣南客家文艺学院（在建）

中国稀金谷稀金产业学院（与和君职业学院、赣县区政府、国家稀土功能材料创新中心、江西理工大学合作共建的产业学院）

和君职业学院（与上述合作共建稀金产业学院）

赣县区开放学院（原赣州广播电视大学赣县教学点，现更名为赣县区开放学院）

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