南京的二本大学包括以下几所：

南京工程学院：

以工程技术为主，是江苏省属的工科型二本院校，近年来在工程学科方面成绩显著。

南京晓庄学院：

以师范教育为特色，历史悠久，是南京市民办教育的佼佼者。

南京信息工程大学：

虽为民办，但在信息技术领域享有很高声誉，是国家级示范性软件学院。

南京审计大学：

以审计专业著称，毕业生就业率一直较高。

南京工业大学：

拥有百年办学历史，以化学工程与工艺、计算机科学与技术、安全工程、土木工程、材料科学与工程、无机非金属材料工程等专业为优势。

南京林业大学：

多学科协调发展，部分专业录取分数超过一本线。

南京医科大学：

办学历史悠久，优势专业包括预防医学、临床医学、口腔医学、康复治疗学、护理学等。

南京财经大学：

注重教学质量和科学研究，拥有优秀的师资力量和完备的教学设施。

金陵科技学院：

注重教学质量和科学研究，部分专业录取分数超过一本线。

南京邮电大学：

以信息科技为特色，优势专业包括通信工程、电子信息工程等。

南京中医药大学：

以中医药学科为主，优势专业包括中医学、中药学等。

江苏警官学院、 南京警察学院、 江苏第二师范学院、 南京特殊教育师范学院、 南京体育学院、 南京工业职业技术大学、 南京传媒学院、 三江学院等也是南京的二本院校。

建议根据个人兴趣和专业方向选择合适的学校，同时考虑学校的办学实力、师资力量和就业情况。