以下是一些在治疗头疼方面比较专业的三甲医院排名：

四川大学华西医院

成都市第三人民医院

成都医学院附属医院

川北医学院附属医院

齐齐哈尔医学院附属第三医院

哈尔滨市第四医院

哈尔滨二四二医院

齐齐哈尔医学院第一附属医院

南方医科大学南方医院

上海市公共卫生临床中心

上海市中医医院

上海市第十人民医院

上海市宝山区中西医结合医院

广州医科大学附属第二医院

广医三院

南方医科大学中西医结合医院

广州市惠爱医院

中山大学附属第六医院

宁夏中医研究院

银川市中医院

西藏自治区人民医院

广州明康中医院

舟山市妇幼保健院

上海新科脑康医院

成都脑康医院

北京协和医院

北京天坛医院

复旦大学附属华山医院

这些医院在治疗头疼方面都有较高的专业水平和丰富的临床经验。建议您根据自己所在地区和具体需求，选择合适的医院进行咨询和治疗。