新疆单列本科大学主要包括以下几所：

新疆大学

塔里木大学

新疆农业大学

石河子大学

新疆医科大学

新疆师范大学

喀什大学

伊犁师范大学

新疆财经大学

新疆艺术学院

新疆工程学院

昌吉学院

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