根据最新的排名信息，自动化专业排名前五的大学如下：

清华大学

浙江大学

北京航空航天大学

上海交通大学

北京理工大学

此外，还有一些非985和211但排名靠前的院校可以考虑，例如：

广东工业大学（第28名）

杭州电子科技大学（第31名）

浙江工业大学（第35名）

这些信息基于最新的排名数据，因此建议在做出选择时，进一步核实最新的排名信息。