校史之争的大学主要有以下几对：

南京大学VS东南大学

南京大学位列华东五校和C9联盟，东南大学也是985高校之一。两校的历史渊源可以追溯到1952年南京大学分出的南京工学院（后发展为东南大学）和金陵大学（后改为南京大学）。理论上，这两者都有南京大学的血脉，但谁是正统存在争议。

上海交通大学VS西安交通大学

上海交通大学和西安交通大学在校史上的争议主要源于它们都是交通大学，且有着各自的悠久历史。有人建议合并这两所大学，但合并后的管理问题以及西交迁走后的影响也是争议的焦点。

武汉大学VS天津大学

武汉大学将校史追溯到1893年创办的自强学堂，而天津大学的前身是1909年创办的焦作路矿学堂。虽然两校在历史上有过联系，但具体谁更“正统”存在争议。

中国矿业大学VS河南理工大学

中国矿业大学和河南理工大学都起源于1909年创办的焦作路矿学堂。中国矿业大学在新中国成立后迁至天津并更名，而河南理工大学则留在原址并发展。两校在校史上有过争议，特别是在新中国成立后校史的归属问题。

安徽大学VS安徽师范大学

安徽大学和安徽师范大学在校史上有过争议，特别是在徽学研究、211工程等主要方面。安徽大学在2021年通过官方微信公众号发布文章，试图明确其校史，但引发了一些争议。

湖南大学

湖南大学将其校史追溯到宋代岳麓书院，这一说法被一些教授质疑为牵强附会，认为这种追溯不尊重历史，甚至可能将校史弄成笑柄。

华中大学

华中大学的历史存在争议，有人认为其历史应归于中华大学，而中华大学与华中大学的关系复杂，存在不同的解读。

这些校史之争反映了不同高校在历史和身份认同上的复杂性，也提醒我们在处理校史问题时需要严谨和尊重历史事实。