根据2025年校友会排名，新疆自治区大学排名如下：

新疆大学：

全国排名第175名。

新疆医科大学：

全国排名第225名。

石河子大学：

全国排名第231名。

新疆农业大学：

全国排名第235名。

新疆师范大学：

全国排名第245名。

塔里木大学：

全国排名第306名。

新疆财经大学：

全国排名第334名。

伊犁师范大学：

全国排名第353名。

喀什大学：

全国排名第409名。

昌吉学院：

全国排名第441名。

建议：

新疆大学作为新疆自治区排名第一的高校，全国排名也相对较高，显示出其在教学、科研和社会服务方面的较强实力。

石河子大学和 新疆医科大学紧随其后，分别位列第二和第三名，这两所高校在医学和农业科学领域有显著优势。

新疆师范大学和 新疆农业大学也表现不错，分别位列第五和第四名，显示出其在教育学和农业科学方面的较强实力。

塔里木大学、 新疆财经大学、 伊犁师范大学、 喀什大学和 昌吉学院虽然排名相对靠后，但也在全国范围内有一定的影响力，特别是在各自的特色领域。

这些排名为考生选择高校提供了重要参考，建议根据个人兴趣和职业规划选择合适的学校。