大学地理系面临的难题主要包括以下几个方面：

教育资源分配不均：

不同地区或学校之间在地理教育资源上可能存在较大差异。

课程设置不合理：

课程内容可能未能充分覆盖地理学的各个方面，或者与行业需求脱节。

实践教学不足：

地理学科需要大量的实地考察和野外实习，但实践教学环节可能因资源或时间限制而不足。

学科交叉融合：

地理学与其他学科如环境科学、生态学、城市规划等的交叉融合越来越明显，这对地理教育提出了更高的要求。

学科布局不合理：

部分高校地理教育学科专业群可能存在重复建设、资源浪费等问题，需要优化学科布局。

科研成果丰硕但应用不足：

虽然地理学研究可能取得了很多成果，但在将科研成果转化为实际应用方面可能存在挑战。

理论与实践的结合：

地理学的理论知识需要在实践中得到验证和应用，这对学生和老师都是一个挑战。

地理综合研究难题：

地理综合是将地理要素综合起来进行研究的过程，这需要融合还原论与整体论的方法，是地理学研究的长期难题。

教学内容与实际应用脱节：

一些教学题目可能过于理论化，缺乏实际应用价值，不利于学生理解和应用地理知识。

新技术应用：

如遥感（RS）和地理信息系统（GIS）等新技术在地理学中的应用需要进一步普及和深化。

学科理论真空化：

学科理论未能跟上学科发展的步伐，缺乏创新。

基础削弱，地理特色淡化：

过分强调应用，忽视了地理学科的基础知识和特色培养。

学科发展滞后于社会、经济发展：

地理学科的发展未能及时适应社会和经济的需求。

教学体系紊乱：

课程设置和教学安排不够合理，缺乏系统性和连贯性。

师资力量减弱：

教师数量和质量不足，难以满足教学需求。

学生质量下降：

学生的基础知识和应用能力不强，难以适应社会需求。

自然地理问题：

包括水土流失、荒漠化、地球的结构和形状、气候差异、自然灾害等。

人文地理问题：

如工业区位分析、人口迁移、城市地理、农业地域类型、文化地理等。

地理信息系统（GIS）问题：

包括空间数据分析、遥感技术等。

环境地理问题：

如环境保护、可持续发展、环境污染等。

区域地理问题：

如大洲与大洋、国家地理、地区差异等。

地球板块运动：

理解板块的运动机制、动力来源及其对地形地貌的影响。

地球磁极移动：

掌握地球磁极移动的规律及其对地球环境和生物多样性的影响。

气候系统：

理解气候的形成、变化及其对全球气候系统的影响。

水循环：

掌握水循环的过程、影响因素及其对全球水资源分布的影响。

自然地理计算：

如太阳高度角、时区计算等，需要一定的数学和物理知识。

地球资源分布：

理解地球资源的形成、分布规律及其与环境的关系。

环境变迁对生物多样性的影响：

分析自然环境变化对生物多样性的影响。

全球气候变化：

理解气候变化的原因、影响及应对措施。

自然灾害：

分析自然灾害的成因、影响及预防措施。

31. 综合案例分析：如从地球的诞生到地质演变的整个过程，涉及地球地质学、大气科学、生物学等多个学科的综合分析。

这些难题需要教育者、研究者和学生共同努力，通过改进教学方法、加强实践教学、优化课程设置、更新教学内容等方式来应对。