袁世凯创办的著名大学包括：

山东大学堂 （山东大学前身）：

1901年，袁世凯在山东创办了山东大学堂，这是中国第二个官立大学堂，也是晚清时期地方政府建立的第一所大学堂。

保定军校（陆军军官学校）：

1912年，袁世凯在保定创办了陆军军官学校，简称保定军校，是中国近代史上第一所正规陆军学校。

南苑航空学校：

1913年9月，袁世凯任命秦国镛为第一任校长，成立了南苑航校，这是中国最早的航空学校之一。

陆军行营军官学堂（陆大前身）：由袁世凯包办成立，1907年陆军部军咨处成立，改隶于军咨处，1912年改名为陆军预备大学堂，后改为陆军大学。

河北农大：

由袁世凯创建，慈禧太后亲批“知道了”。

此外，袁世凯在担任山东巡抚和直隶总督期间，还创办了其他一些军事院校和学堂，如北洋武备学堂、北洋陆军速成学堂等。