常熟理工学院有以下几个王牌专业：

自动化：

自动化专业是常熟理工学院的王牌专业，主要学习机械、自动化等相关的知识和软硬件操作、动手能力，毕业后的就业率较高。

数学与应用数学：

数学与应用数学也是学校的王牌专业，有两个主要方向：师范方向和软件方向。师范方向主要是学习数学知识及教学技能，软件方向则从事软件设计、研发和管理工作。

机械工程：

学校拥有机械制造及其自动化、车辆工程等优势方向，专注于服务地方制造业，培养高素质应用型工程技术人才，学生就业率和专业对口率较高。

材料科学与工程：

重点研究新型材料及其加工工艺，涉及金属材料、高分子材料和功能材料等领域，服务于长三角地区的先进制造业和新材料产业。

电气工程及其自动化：

学科注重电气控制系统、智能电网和新能源方向，实验室设备完善，拥有产学研一体化的实践平台。

化学与环境工程：

环境科学与工程和化学工程与工艺是特色专业，研究方向包括环境治理技术、新型催化剂开发和化工过程优化。

新能源科学与工程：

该专业也是常熟理工学院的王牌专业之一。

生物工程：

生物工程专业也被视为常熟理工学院的优势专业。

电子信息工程：

该专业在常熟理工学院中也有很好的口碑。

计算机科学与技术：

计算机科学与技术专业也是学校的重点专业之一。

市场营销：

市场营销专业也被视为常熟理工学院的优势专业。

食品质量与安全：

该专业也是学校的特色专业之一。

这些专业在就业市场上都有较好的前景，尤其是自动化、数学与应用数学、机械工程等王牌专业，毕业生在相关行业中需求量大，就业率较高。建议根据个人兴趣和职业规划选择合适的专业。