在港口工作报考注册安全工程师时，可以选择交通运输类或建筑施工安全专业。具体选择哪个专业取决于你的工作内容偏重港口安全管理的哪个方面。

交通运输类：

这个类别包括铁路、道路等，港口与航道是否归在此类需要查阅相关文件。

建筑施工安全专业：

这个专业适用于从事安全生产管理、安全监督检查、安全工程技术检测检验、安全属性辨识、建设项目的安全评估和安全咨询工作的建筑专业人员。

建议根据你的具体工作内容和兴趣，选择最符合的专业进行报考。