河海大学在南京市和常州市共设有三个校区，具体如下：

西康路校区：

位于江苏省南京市鼓楼区西康路1号，是河海大学的主校区，包含了体育系、理学院、海洋学院、环境学院、土木与交通学院、港口海岸与近海工程学院、水利水电学院、水文水资源学院等多个学院。

江宁校区：

具体地址未详细列出，但同样位于南京市，可能涉及多个学院或研究机构。

常州校区：

位于江苏省常州市，具体地址包括金坛长荡湖畔和溧阳天目湖附近。金坛校区设有10个学院，能够培养本硕博三个层次的人才。溧阳校区则重点布局生物医学工程等前沿领域。

这些校区共同支撑着河海大学以水利为特色，工科为主，多学科协调发展的办学模式。