袁世凯在任期间，对中国高等教育做出了显著贡献，他参与或促成了以下大学的建立：

山东大学堂 （山东大学前身）：

1901年由袁世凯在山东巡抚任上创立，是中国第二个官立大学堂，标志着晚清时期地方政府创办新式学校的开始。

保定陆军军官学校：

袁世凯在任直隶总督期间，在保定和天津创办了多所军事院校，其中保定陆军军官学校后来成为全国规模最大的正规军事院校之一。

东北大学：

成立于1923年，由奉系军阀张作霖筹办，是东北地区最高学府，当时经费充裕，吸引了许多学者和教授。

东南大学：

与袁世凯的孙子袁家骝（袁克文的儿子）有关联，东南大学建有吴健雄学院和纪念馆，吴健雄是知名物理学家，其妻子毕业于东南大学。

南苑航空学校：

1913年9月，袁世凯任命秦国镛为第一任校长，成立了南苑航校，这是中国最早的航空学校之一。

陆军行营军官学堂（陆大前身）：由袁世凯包办成立，1907年陆军部军咨处成立，改隶于军咨处，1912年改名为陆军预备大学堂，后改为陆军大学。

河北农大：

由袁世凯创建，慈禧太后亲批“知道了”。

这些大学的建立，不仅推动了当时中国高等教育的发展，也为后世培养了大量的人才。