以下是一些被认为在招生、学科发展或社会声誉等方面遭遇挑战的大学：

河南大学：

历史悠久，但由于院系调整和地理位置变化，其发展受到限制，甚至未能入选211工程大学。

河北工业大学：

位于天津，由于天津从河北直辖，导致该校在地区内的地位和资源分配上遇到挑战。

东华大学（原名中国纺织大学）：

由于纺织行业不景气，导致生源质量下降，更名之举也引起了一些争议。

南昌大学（原名国立中正大学）：

在1950年代的院系调整中，许多专业被拆分并并入其他高校，导致其影响力减弱。

中山大学：

作为一所顶级985高校，在某些省份的招生中遭遇断档，录取分数线大幅下降。

南京工业大学：

尽管不是211工程，但在化工、建材领域有很强的实力，并在教育部评估中获得不错的成绩。

燕山大学：

拥有材料科技领域的实力，并在国内有重大影响的国家重点实验室，但在某些排名和评价中可能未得到充分认可。

兰州大学：

地理位置不佳，难以吸引优质师资和生源。

北京医科大学：

曾是北京211大学之一，与北京合并后更名为北京大学医学部。

上海工商学院：

冒用上海工商职业技术学院的前身，后并入上海新侨职业技术学院。

四川联合大学：

冒用四川大学的曾用名，后恢复为四川大学。

上海工程技术大学：

录取分数线下降，与一本线差距大。

上海海事大学：

分数线下降，接近二本线。

上海海洋大学：

面临挑战，但具体细节不详。

河南理工大学：

原国立焦作工学院，后分拆成立西北工业大学和中国地质大学，留给焦作的是一个空壳。

山西大学：

曾经享誉全国，但随着政策调整和区域经济发展不平衡，未能进入“211工程”行列。

吉林大学：

虽然校园面积大，学生人数多，但地理位置位于东北，可能面临吸引人才和科研资源的挑战。

南开大学：

曾经与北京大学、清华大学齐名，但随着时代发展和高等教育格局变化，排名有所下滑。

河海大学：

虽然以水利为特色，工科为优势，但校名中的“河、海”两个字显得随意，影响了其独特性。

江南大学：

位于华东地区，具体挑战不详。

深圳大学：

虽为“双非”高校，但在师资建设和学科发展上表现出色。

东北财经大学：

在财经领域有很高的声誉，但可能因为名字的辨识度不高而影响其知名度。

这些大学在不同程度上都面临着挑战，可能是由于地理位置、行业变迁、政策调整、院系拆分等多种因素的影响。