西昌学院最好就业的专业主要包括以下几个：

动物医学：

作为西昌学院的王牌专业之一，动物医学专业在学科建设、师资力量及科研实力等方面均处于国内领先水平。该专业旨在培养具备扎实的动物医学基础理论、基本知识和基本技能的高素质应用型人才。毕业生可在兽医医疗、动物防疫检疫、兽药研发及生产等领域从事相关工作。

食品科学与工程：

食品科学与工程专业是西昌学院的另一大特色专业。该专业注重培养学生的实践能力和创新精神，为学生提供了丰富的实践机会和实验平台。毕业生可在食品加工、食品质量控制、食品安全管理等领域从事相关工作。

农学：

农学专业是西昌学院的传统优势专业之一。该专业旨在培养具备扎实的农学基础理论、基本知识和基本技能的高素质应用型人才。毕业生可在农业生产、农业技术推广、农业企业管理等领域从事相关工作。

水利水电工程：

水利水电工程专业是西昌学院的又一特色专业。该专业注重培养学生的工程实践能力和创新能力，为学生提供了丰富的实践机会和实验平台。毕业生可在水利水电工程设计、施工、管理等领域从事相关工作。

这些专业在就业市场上具有较强的竞争力，毕业生可以根据自己的兴趣和职业规划选择适合的专业。建议学生在选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣、职业规划以及专业的就业前景和市场需求。