重庆高考考三天的主要原因是为了 适应教育改革的需要，全面考察学生的综合素质和能力。随着教育改革的不断深入，高考的考试科目从单一的文化课扩展到了包括文化课、选考科目和综合素质评价等多个方面，导致考试时间需要相应增加。具体来说，新高考实行了“3+1+2”的考试模式，其中“1”代表一门必选科目，“2”代表两门选考科目，这样的模式需要三天来完成所有考试。

此外，将高考分为多天进行可以减轻考生的心理和身体负担，有助于他们在考试中保持集中和高效。分散考试时间还可以减少泄题和舞弊的风险，使考试结果更真实地反映学生的学业水平。

综上所述，重庆高考考三天是为了适应教育改革的需要，更好地考察学生的综合素质和能力，同时减轻考生的考试压力，提高考试效果和公平性。