2025年上海市南通市的大学排名如下：

南通大学：

在ABC中国大学排名中位居南通市大学排名第一，全国排名第159名。

南通理工学院：

在ABC中国大学排名中位居南通市民办大学排名第一。

南通职业大学：

在ABC中国大学排名中位居南通市高职院校排名第一。

建议：

南通大学作为南通市乃至江苏省内的重要高校，具有较强的综合实力和竞争力，建议优先考虑。

南通理工学院作为民办本科院校，在南通市排名靠前，也具备一定的教学水平和综合实力。

南通职业大学在高职院校中排名第一，适合希望从事职业教育的学生选择。