东京市区的大学众多，涵盖了国立、公立和私立大学。以下是一些主要的大学：

国立大学

东京大学：日本最古老、历史悠久的综合性大学之一，位于文京区。

东京工业大学：专注于理工科研究和教育，位于目黑区与横浜市绿区。

东京医科齿科大学：以医学和牙科教育著称，位于文京区。

一桥大学：以商科教育闻名，位于国立市。

东京海洋大学：以海洋科学和工程为主。

东京农工大学：以农业和生命科学等领域为主。

东京国立美术音乐大学：专注于艺术和音乐教育。

东京农业科技大学：以农业和生命科学等领域为主。

东京外国语大学：专注于语言教学和研究，位于府中市。

公立大学

首都大学东京（原名是首都大学东京）：提供广泛的学科教育。

产业技术大学院大学：专注于产业技术研究和教育。

私立大学

早稻田大学：日本顶尖的私立大学之一。

庆应义塾大学：以商科和法学教育闻名。

明治大学：综合性大学，以商科和法学教育著称。

中央大学：以文学和法学教育著称。

立教大学：以教育学和社会科学教育著称。

上智大学：以国际关系和法学教育闻名。

法政大学：以法学和政治学教育著称。

专修大学：以商科和法学教育著称。

日本大学：综合性大学，提供广泛的学科教育。

城西大学：综合性大学。

城西国际大学：国际交流和商科教育著称。

共立女子大学：以女性教育为主。

圣路加国际大学：以医学和护理教育著称。

这些大学在东京市区内各具特色，涵盖了广泛的学科领域，为东京乃至日本的教育和科研做出了重要贡献。