高三补课不违法的原因主要在于 国家没有明确的法律规定禁止高三补课。虽然《未成年人学校保护规定》第十三条要求学校科学合理安排学生在校作息时间，保证学生有休息、参加文娱活动和体育锻炼的机会和时间，不得统一要求学生在规定的上课时间前到校参加课程教学活动，但这并不直接等同于禁止高三补课。

此外，教育局的要求和学校的规定也起到了重要作用。教育局明确要求除高三外，各学校不得利用假期补课，并且学校补课实行“三愿”原则，即学生自愿、家长自愿、教师自愿。如果高三学生不愿意补课，可以直接向老师和学校说明不参加补课。

综上所述，高三补课不违法的原因在于国家没有明确的法律规定禁止这一行为，并且教育局和学校的规定也允许在自愿原则下进行补课。