重庆直管大学有以下两所：

重庆大学：

简称“重大”，是中央直辖市重庆直管的教育部直属副部级全国重点大学，由国家“双一流”、“211工程”和“985工程”首批重点建设的高水平研究型综合性大学。

西南大学：

简称“西大”，位于重庆市北碚区，是国家“211工程”大学。

这两所大学都是直管大学，并且都是国家“双一流”建设高校。