南京上榜的大学包括：

南京大学

985工程

211工程

双一流学科优势：天文学、地质学、图书情报与档案管理

东南大学

985工程

211工程

双一流学科优势：建筑学、土木工程、交通运输工程、生物医学工程、艺术学理论

南京航空航天大学

211工程

双一流学科优势：力学、机械工程、管理科学与工程

南京理工大学

211工程

双一流学科优势：兵器科学与技术、化学工程与技术

河海大学

双一流学科优势：水利工程、环境科学与工程

南京农业大学

211工程

双一流学科优势：农业科学、生命科学

南京师范大学

211工程

双一流学科优势：教育学、心理学、人文社科等

中国矿业大学

双一流学科优势：矿业工程

江南大学

双一流学科优势：食品科学与工程

南京医科大学

全国第4名（医药类）

这些学校在南京乃至全国都有较高的学术声誉和影响力，涵盖了多个学科领域，为国家和地方培养了大量优秀人才。建议根据最新的教育部门权威信息，进一步确认具体排名和学科优势。