2006年中国大学排名如下：

清华大学

北京大学

浙江大学

上海交通大学

复旦大学

南京大学

中国科学技术大学

同济大学

四川大学

华中科技大学

这些排名是根据学术研究、教学质量、师资力量等多个指标综合评估得出的。清华大学和北京大学作为顶尖综合性大学，长期位居榜首，而复旦大学、上海交通大学和浙江大学等高校也表现出色，位列前茅。