1999年中国大学排名如下：

清华大学- 综合得分：

100.00， 学术声誉得分：

100.00， 论文得分：

100.00

北京大学- 综合得分：99.61， 学术声誉得分：99.61， 论文得分：45.67

南京大学- 综合得分：91.86， 学术声誉得分：64.03， 论文得分：64.03

复旦大学- 综合得分：90.23， 学术声誉得分：96.89， 论文得分：96.89

中国科学技术大学- 综合得分：89.97， 学术声誉得分：65.69， 论文得分：65.69

中国协和医科大学- 综合得分：87.60， 学术声誉得分：无数据， 论文得分：无数据

浙江大学- 综合得分：87.36， 学术声誉得分：无数据， 论文得分：无数据

上海交通大学- 综合得分：85.18， 学术声誉得分：无数据， 论文得分：无数据

南开大学- 综合得分：80.00， 学术声誉得分：无数据， 论文得分：无数据

建议：

这些排名基于1999年的数据，排名可能会随着时间的推移和评价标准的变化而有所调整。

如果需要更详细的信息，可能需要查找当年的具体排名数据。