火箭军工程大学的专业设置涵盖了多个领域，主要包括以下专业：

机械工程及其自动化：

包括导弹装备维修与管理。

电气工程及其自动化：

包括电力工程领域的技术与应用，如导弹阵地管理。

通信工程：

包括有线通信指挥、无线通信指挥、移动通信等。

飞行器动力工程：

涉及飞行器动力系统的设计与维护。

特种能源技术与工程：

专注于特种能源技术的研发与应用。

辐射防护与核安全：

核设施的安全防护与核技术安全管理。

侦测工程：

涉及侦察与监测技术。

测控工程：

对目标进行跟踪、测量和控制的技术。

土木工程：

土木工程的规划、设计、施工等。

火力指挥与控制工程：

火力系统的指挥与控制。

武器发射工程：

导弹发射技术与指挥。

指挥信息系统工程：

导弹通信技术与指挥。

核工程与核技术：

器材装配检测。

目标工程：

导弹作战保障。

导弹工程：

包括导弹发射技术与指挥、导弹测控技术与指挥。

信息安全。

工程物理。

电力工程及其自动化。

电子工程。

这些专业旨在培养具备专业技能和军事素养的火箭军人才，为国家的国防事业做出贡献。