高考高校专项计划虽然为农村及其他特定条件的学生提供了更多的教育机会，但也存在一些弊端。以下是一些主要的弊端：

可选专业有限：

高校专项计划的学生在选择专业时，可选范围相对较小。与统招相比，专业选择可能受到限制，尤其是热门专业可能不在选择之内。

院校和分数限制：

该计划只针对特定的985、211等名校，且录取分数通常需要在一本线以上。这意味着并非所有学生都能随意选择心仪的院校，且分数要求相对较高。

竞争压力较大：

尽管高校专项计划面向农村学生，但由于其降分政策较为优惠，每年报考该计划的学生数量不断增加，导致竞争压力也随之增大。

需要签订协议：

许多高校专项计划要求学生签订毕业后回生源地工作的协议，这可能限制学生的职业选择和发展空间。此外，一些协议可能规定较长的服务期限，如五年，这会影响学生未来的职业规划。

可能影响高考复习：

由于高校专项计划需要单独报名和提交大量资料，学生需要花费额外的时间和精力来准备和查询相关信息，这可能会对他们的正常高考复习造成一定影响。

资源不均衡：

高校专项计划的实施可能导致资源分配不均衡，一些得到大量资金和支持的高校可能会提高教育质量，而其他学校则可能面临资源匮乏的问题。

学术偏离和功利倾向：

为了争取专项资金，一些高校可能过度注重应用性研究，忽视基础性研究，导致学术发展的失衡。

心理负担：

由于高校专项计划的录取标准和要求较高，一些学生可能会感受到较大的心理压力，担心自己无法达到预期的目标。

综上所述，高考高校专项计划在为特定学生提供教育机会的同时，也存在一些限制和弊端。学生在选择是否报考时，应充分了解并权衡这些利弊。