根据2024年软科北京市大学排名，北京的大学排名前三如下：

清华大学：

作为国内顶尖的综合类学校，清华大学在多个排名中均位列北京第一，全国排名中也常常位居榜首。

北京大学：

与清华大学齐名，北京大学通常位于全国排名的第二名，在北京市的排名中也是第一。

北京航空航天大学：

北京航空航天大学在理工科领域表现卓越，全国排名第十，是北京顶尖的985高校。

这三所高校在中国高等教育中占据着举足轻重的地位，各自在工科、理科和人文社会科学等领域具有显著的优势。