吉首市的高等院校主要有以下几所：

吉首大学：

简称“吉大”，学校地跨吉首市和张家界市两地办学，是国家民族事务委员会与湖南省人民政府省部共建大学，湖南省国内一流学科建设高校，入选国家“中西部高校基础能力建设工程”、“卓越医生教育培养计划”、“卓越农林人才教育培养计划”、“服务国家特殊需求博士人才培养项目”、“湖南省2011计划”，为中国服务外包校企联盟成员单位。

吉首大学师范学院：

2024年10月12日，吉首大学师范学院实质性融入吉首大学，标志着潕溪书院这一古老文脉将历史性地溶进吉首大学的血脉中，书院启迪民智的使命将在此得以续传。

湘西民族职业技术学院：

位于吉首市，是一所大专类院校，主要招收部分大专和中专生。

建议：

吉首大学是吉首市最好的高等学府，综合性强，学科门类齐全，建议优先考虑报考。

吉首大学师范学院已实质性融入吉首大学，其专业和资源也将融入吉首大学，可以考虑其相关专业的报考。

湘西民族职业技术学院适合对特定专业或职业技能培训感兴趣的学生。