上海交通最好的大学排名如下：

上海交通大学

在软科2024中国大学排行榜中，全国排名第4位。

在校友会2024中国大学排行榜中，全国排名第5位。

在2024年软科中国大学排名中，位列第4位。

在2024年校友会中国大学排名中，位列第5位。

在2025年QS亚洲地区大学排名中，排名亚洲第14，全国第5。

在2025年泰晤士世界大学排名中，全球排名为52名，内地排名第5位。

复旦大学

在软科2024中国大学排行榜中，全国排名第5位。

在校友会2024中国大学排行榜中，全国排名第5位。

同济大学

在软科2024中国大学排行榜中，全国排名第17位。

在交通运输专业排名前3的大学中，排名第1。

建议：上海交通大学和复旦大学在交通方面的专业均非常出色，并且在全国大学排名中位居前列，是上海市乃至全国最好的大学之一。同济大学在交通运输专业方面也表现优异，位列全国第三。