昌平区的自主招生大学主要包括以下几所：

北京交通职业技术学院：

公办全日制普通高等职业学院，隶属于北京市昌平区人民政府。

北京财贸职业学院：

公办全日制普通高等职业学院。

首钢工学院：

位于石景山区，是一所公办院校。

北京演艺专修学院：

位于昌平区，是一所公办院校。

首都经济贸易大学：

位于昌平区。

中国石油大学：

位于昌平区。

中国政法大学：

位于昌平区。

北京师范大学：

位于昌平区沙河大学城。

北京吉利大学：

位于马池口镇北小营，是一所民办大学。

北京科技职业学院：

位于昌平区沙河沙阳路18号，高职自主招生。

北京戏曲艺术职业学院：

位于丰台区马家堡东里8号，虽然位于丰台区，但也是北京市内的一所高职院校。

建议您在考虑申请之前，直接咨询相关院校或访问它们的官方网站获取最新信息，以确认最新的招生情况和专业设置。