高三填写的档案是毕业生登记档案，其内容主要包括以下五个部分：

报名信息：

记录学生在高考报名时的基本信息。

体检信息：

包含学生的体检结果和相关健康信息。

志愿信息：

记录学生填报的高考志愿。

成绩信息：

包含学生在高考中的各科成绩。

考生参加高考的诚信纪录：

记录学生在高考中的诚信情况。

此外，高考档案还包括电子档案和纸质档案两种形式：

电子档案：由考试院提供给考生投档的高校，内容包括《浙江省普通高校招生考试考生报名登记表》、高考成绩与志愿、体格检查表、综合素质信息表等。

纸质档案：由考生拿录取通知书到高中学校领取，大学开学报到后移交给录取高校。

这些档案在高考后要随学生一起转到大学，是高校录取新生的重要依据。