截至2025年，新疆省内大学排名如下：

新疆大学：

全国排名第123位，省内排名第1。

石河子大学：

全国排名第138位，省内排名第2。

新疆医科大学：

全国排名第225位，省内排名第3。

新疆农业大学：

全国排名第235位，省内排名第4。

新疆师范大学：

全国排名第245位，省内排名第5。

塔里木大学：

全国未明确列出，但省内排名第6。

新疆财经大学：

全国未明确列出，但省内排名第7。

伊犁师范大学：

全国未明确列出，但省内排名第8。

喀什大学：

全国未明确列出，但省内排名第9。

昌吉学院：

全国未明确列出，但省内排名第10。

建议：

新疆大学作为新疆地区的顶尖综合性大学，拥有较高的教学水平和研究实力，是首选。

石河子大学和 新疆医科大学也是新疆省内较为知名的高校，具有较高的教学和研究水平。

新疆农业大学和 新疆师范大学在农业和师范教育领域有较强实力。

塔里木大学、 新疆财经大学、 伊犁师范大学和 喀什大学等高校在各自领域内也有一定的影响力。

昌吉学院作为地方性院校，近年来发展迅速，也值得关注。