高三女生在参加体检时，应该选择 内衣或短裤作为穿着，以便医生能够全面观察和检查学生的身体状况。具体来说，可能需要脱掉外衣，只穿内衣或短裤进行检查。这是因为在进行身体检查时，医务人员需要全面地观察和检查学生的身体状况，包括皮肤、骨骼、肌肉、脊柱、胸部、腹部、生殖器等各个方面。而穿着厚重的衣物会影响医生对身体的观察和检查，因此要求学生在进行体检时只穿着内衣或短裤，以方便医生进行全面的检查。

如果学校有统一要求，必须着装校服，那么女生应该穿着校服前往医院体检。

建议提前了解所在地区和医院的体检要求，以确保穿着合适的服装参加体检。