崇明区目前有以下几所大学：

上海大学崇明校区

东华大学崇明校区

上海外国语大学崇明校区

上海海洋大学崇明校区

上海外国语大学贤达人文学院崇明校区

上海电机学院崇明学院

上海视觉艺术学院崇明校区

复旦崇明创新中心

华东师大崇明生态研究院

上海海事大学

上海工艺美术职业学院

上海济光职业技术学院

上海交通大学崇明校区

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