日本高三生的毕业时间通常是 每年的三月。

具体来说，日本高中生的毕业时间一般是在每年的三月份，而高校的毕业典礼则通常会在2月下旬至3月初举行。因此，三月的樱花季既是毕业的季节，也是入学的季节，更是全新出发的季节。

此外，虽然有些资料提到日本一般是在三月中下旬结束一个学年，并在四月上旬开始新的一个学年，但这并不影响高三生的毕业时间，他们仍然是在三月毕业。

综上所述，日本高三生的毕业时间是每年的三月。