在清朝时期，有几所著名的大学，它们在当时享有很高的声誉，并对中国的教育产生了深远的影响。以下是其中几所著名的大学：

京师大学堂 （北京大学前身）：由光绪皇帝颁布《明定国是诏》，推行戊戌变法时创办，是中国近代高等教育的开端。

北洋大学堂（天津大学前身）：最早创建于1895年，是中国第一所近代大学，原名北洋西学学堂，后更名为北洋大学堂。

福建船政学堂：

成立于1866年，是清朝为培养海军人才而设立的学校，位于福建福州马尾港。

山西大学堂：

成立于1902年，与京师大学堂和北洋大学堂一起被称为中国最早的三所大学堂之一。

广雅书院（广州）：在清朝时期也是一所知名的高等学府。

两湖书院（武汉）：在清朝时期也是一所知名的高等学府。

自强学堂（武汉）：追溯到1893年，是中国近代第一所由地方政府创办的综合性大学，后定名为国立武汉大学。

南洋公学（上海交通大学前身）：成立于1896年，是中国历史最悠久的高等学府之一，后经过多次更名，最终分为上海交通大学和西安交通大学。

北洋水师学堂：

按照李鸿章的要求而成立，于1881年8月正式建成，为北洋海军提供了丰富的技术人才。

北洋武备学堂：

1884年，李鸿章为培养军事人才而建立，按照德国的标准进行了培训。

这些大学在当时都享有较高的声誉，并为中国近代教育的发展做出了重要贡献。