福建旗山校区有以下几所大学：

集美大学（Jimei University），简称“集大”，英文缩写“JMU”，位于厦门市，是由福建省人民政府举办、福建省教育厅管理的高等院校。

福建农林大学（Fujian Agriculture and Forestry University），简称“农林大”，位于福州市，是一所以农林科学、生命科学为优势和特色，理、工、经、管、文、法、艺等多学科协调发展的省属重点大学。

福州大学（Fujian University），简称“福大”，位于福州市，是一所综合性大学。

福建师范大学（Fujian Normal University），简称“师大”，位于福州市，是一所以师范教育为特色的大学。

福建医科大学（Fujian Medical University），简称“福医大”，位于福州市，是一所医学类大学。

福建中医药大学（Fujian University of Traditional Chinese Medicine），简称“福中医大”，位于福州市，是一所中医药类大学。

闽江学院（Minjiang College），位于福州市，是一所地方性综合大学。

福建工程学院（Fujian University of Technology），已更名为福建理工大学，位于福州市，是一所理工类大学。

福建教育学院（Fujian Education College），位于福州市，是一所师范类大学。

江夏学院（Jiangxia College），位于福州市，是一所地方性综合大学。

福建华南女子职业学院（Fujian South China女子学院），位于福州市，是一所民办高职院校。

福建师范大学协和学院（Fujian Normal University Xinhua College），位于福州市，是福建师范大学的独立学院。

福州职业技术学院（Fuzhou Vocational College），位于福州市，是一所高职院校。

这些大学在福建旗山校区提供了丰富的教育资源和学术氛围，吸引了大量的学生前来学习。