爱媛大学设有多个学部和学科，涵盖了从基础学科到专业研究领域。以下是爱媛大学的主要学部和学科设置：

法文学部

综合政策学科

人文学科

教育学部

学校教育教员养成课程

障碍儿童教育教员养成课程

艺术文化课程

健康文化课程

情报文化课程

理学部

数学课

物理学科

化学科

生物学科

地球科学科

工学部

机械工学科

电气电子工学科

环境建设工学科

机能材料工学科

应用化学科

情报工学科

农学部

生物资源学科

医学部

信息未提供详细学科，但提及有医学系研究科

大学院研究科

法文学研究科：综合法政策专攻、人文科学专攻

教育学研究科：学校教育专攻、特别支援教育专攻、教科教育专攻、学校临床心理专攻

理工学研究科

农学研究科

联合农学研究科：与爱媛大学、香川大学、高知大学联合

医学系研究科：医学专攻、看护学专攻

这些学科和研究科为爱媛大学提供了广泛的教育和研究机会，涵盖了人文、社会科学、自然科学、工程、农业和医学等多个领域。